美国的联邦、州和地方各自有自己的税务管理机构，各自的税务管理机构相互无组织上的联系。联邦税务机构为财政部国内收入局，总部设在华盛顿，下设4个大区局（不按行政区划分），4个大区局下设33个地区分局，另有专门处理纳税申报的10个服务中心。州和地方税务局负责州税和地方税的征收管理。

一、申报程序及税款的缴纳

美国税制采用自行缴款方式，即联邦以及各州和地方的税法要求纳税人填写年度所得税纳税申报表，报告其应税所得、应纳税额，并根据其已缴纳的税款计算出最终的应纳税额或应退税额。

公司必须按季预缴当年联邦应纳税款，个人必须就其取得的工薪所得、独立经营所得、投资所得、资本利得预缴联邦和州预扣税应纳税额的1/4。大多数州也要求公司和个人预缴公司所得税或个人所得税。

如果在美国从事贸易或经营的外国纳税人已就来源于美国的所得缴纳足额的预提税，则无须填报纳税申报表。

二、审计及申诉

纳税申报表修正完毕后，经分类选出一部分作为审计对象。如果纳税人对欠税通知有异议，可在30天内向国内收入局申诉委员会提出会谈要求。如果纳税人在30天内未提出要求，则国内收入局会发出一个90天函 正式的欠税通知。在此期间，纳税人如有异议，则可选择向税务法庭、美国地区法庭或美国上诉法庭提出诉讼。无论何种方法，纳税人必须先缴清税务部门确认的应纳税额。

三、罚则

对纳税人迟交纳税申报表、迟缴税款、疏忽欺诈等行为，国内收入局可对其进行各种各样的处罚。如果纳税人少报所得税应纳税额达到一定额度，则要处以少纳税额20%的罚款。然而，如果纳税人的纳税申报表的内容详尽，或纳税人的态度较好，则可免予处罚。

四、时效

国内收入局必须在纳税申报表填报后3年内征收欠税款。如果纳税人申报的所得少于其实际毛所得25%，则征收有效期延长为6年。如果纳税人未报纳税，则国内收入局可在任何时候进行征收。